ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΙΚΗ ΑΝΑΛΥΣΗ ΒΙΟΛΟΓΙΚΩΝ ΑΛΛΗΛΟΥΧΙΩΝ

ΜΒ13|ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΙΚΗ ΑΝΑΛΥΣΗ ΒΙΟΛΟΓΙΚΩΝ ΑΛΛΗΛΟΥΧΙΩΝ

Β’ Εξάμηνο
7.5 ECTS

Διδάσκοντες:
Παναγιώτα Κοντού, Άρτεμις Χατζηγεωργίου, Διονύσιος Κανδύλας, Αθανάσιος Κυλώνης, Περράκης Αναστάσης, Παντελεήμων Μπάγκος.

Πατήστε το συνημμένο για να δείτε ή να κατεβάσετε το περίγραμμα μαθήματος
Υπολογιστική Ανάλυση Βιολογικών Αλληλουχιών

Περιγραφή:

Σκοπός του μαθήματος είναι να καλύψει σε βάθος όλες τις έννοιες της Βιοπληροφορικής και της Υπολογιστικής Βιολογίας που άπτονται της υπολογιστικής ανάλυσης βιολογικών αλληλουχιών. Η ύλη περιλαμβάνει τις κλασικές ενότητες τέτοιων μαθημάτων και αναφέρεται στις μεθοδολογίες και τα εργαλεία στοίχισης και αναζήτησης ομοιότητας, αλλά και τις μεθόδους πρόγνωσης. Με το πέρας των μαθημάτων οι φοιτήτριες και οι φοιτητές θα είναι ικανοί να επιλύουν προβλήματα που έχουν να κάνουν με αναζητήσεις σε βάσεις βιολογικών αλληλουχιών διαφόρων τύπων, να χρησιμοποιούν τα βασικά εργαλεία στοίχισης, πολλαπλής στοίχισης και πρόγνωσης δομής και λειτουργίας πρωτεϊνών κατανοώντας τις ιδιαιτερότητες της λειτουργίας τους και να μπορούν να συμμετάσχουν σε μια διεπιστημονική ομάδα συνεισφέροντας την αντίστοιχη τεχνογνωσία στην επίλυση βιολογικών προβλημάτων.

Βιβλιογραφία:
1. ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ, ΜΠΑΓΚΟΣ ΠΑΝΤΕΛΕΗΜΩΝ, “Ελληνικά Ακαδημαϊκά Ηλεκτρονικά Συγγράμματα και Βοηθήματα – Αποθετήριο “”Κάλλιπος”””, 1η/2016, ΑΘΗΝΑ, 59303485
2. Ανάλυση Βιολογικών Αλληλουχιών, R. Durbin, S. R. Eddy, A. Krogh,Gr. Mitchison. Επιστ. Επιμ. Γ. Εμίρης, ΕΚΔΟΣΕΙΣ ΠΕΔΙΟ Α.Ε., 1η /2016, ΑΘΗΝΑ, 50657616
3. Εισαγωγή στους Αλγόριθμους Βιοπληροφορικής, NEIL C. JONES, PAVEL A. PEVZNER, “ΕΚΔΟΣΕΙΣ ΚΛΕΙΔΑΡΙΘΜΟΣ ΕΠΕ” , 1η/2010, ΑΘΗΝΑ, 21522

Ο τελικός βαθμός προκύπτει από μια γραπτή εξέταση με ερωτήσεις πολλαπλής επιλογής ή/και ανάπτυξης (50%) και την αξιολόγηση μιας εργασίας (50%) την οποία οι φοιτητές καλούνται να γράψουν κατά την διάρκεια του εξαμήνου και αφορά την χρήση εργαλείων ανάλυσης αλληλουχιών σε πραγματικά δεδομένα.